计算凝聚态物理研究所的主要研究方向有：

1. 分子及其复合器件的直流、交流特性；
2. 分子及其复合器件的电子自旋特性；
3. 分子器件的量子泵浦、热传输、量子噪声；
4. 分子器件的第一性原理计算;
5. 高介电材料性能的计算。